版纳甜龙竹DNA提取方法及AFLP反应体系建立研究

被引:7
作者
杨清 [1 ,2 ,3 ]
苏光荣 [4 ]
韩蕾 [5 ]
王正良 [1 ]
孙启祥 [5 ]
彭镇华 [5 ]
机构
[1] 中国科学院西双版纳热带植物园
[2] 国际竹藤网络中心
[3] 中国林业科学研究院研究生院
[4] 云南省景洪市林业局
[5] 中国林业科学研究院林研所
关键词
版纳甜龙竹; DNA提取; AFLP; 影响因素;
D O I
暂无
中图分类号
S795 [竹];
学科分类号
090709 [森林培育学];
摘要
用改进的CTAB法,在提取液中加入2%PVP(V/V)和2%β-巯基乙醇,提取到了高质量的基因组DNA,OD260/OD280在1.7~1.9之间,蛋白质、多酚类、色素、RNA等去除较彻底,适于AFLP分析。通过对版纳甜龙竹DNA提取、酶切连接、预扩增、选择性扩增等试验过程中各关键因素的比较研究,建立了优化的AFLP分子标记体系,得到了清晰的AFLP银染指纹图谱,试验结果重复性好。从64对MseI和PstI引物中筛选出8对扩增效果好的引物,利用筛选出8对引物对30份材料进行分析,共扩增出256条多态性带,获得32490个扩增位点,有13289个位点具有多态性,平均每对引物获得4061.25个扩增位点,其中具有多态性的位点为1661.125个,平均多态检出率为40.90%,8对引物组合对版纳甜龙竹30个个体的区分率达到100%。表明AFLP用于版纳甜龙竹种内不同材料间的遗传变异性分析是可行的。
引用
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