中国野生稻及栽培稻核糖体DNA第一转录间隔区序列分析及其系统学意义(英文)

被引：22

作者：

周毅

邹喻苹

洪德元

周骏马

陈受宜

机构：

[1] 中国科学院植物研究所系统与进化植物学开放研究实验室!北京,中国科学院植物研究所系统与进化植物学开放研究实验室!北京,中国科学院植物研究所系统与进化植物学开放研究实验室!北京,中国科学院遗传研究所植物生物技术开放研究实验室!北京,中国科学院

来源：

植物学报 | 1996年 / 10期

关键词：

野生稻; 栽培稻; rDNA第一转录间隔区; 序列分析; 系统发育关系;

D O I：

暂无

中图分类号：

Q946.2 [核酸];

学科分类号：

摘要：

用 PCR技术从产于我国的 3种野生稻和亚洲栽培稻的 2个亚种中特异地扩增和测序了 r DNA的第一转录间隔区。普通野生稻 (Oryza rufipogon)、药用野生稻 (O.officinalis)、疣粒野生稻 (O.granu-lata)和栽培稻的两个亚种 (O.sativa ssp.indica,O.sativa ssp.japonica)的 ITS1序列为 1 93bp、1 94bp、2 1 8bp、1 94bp和 1 94bp,它们的 G/ C含量为 69.3%～ 72 .7% ,序列中位点趋异率为 1 .5%～ 1 0 .6%。序列的相似性比较和简约性分支分析的结果表明 ,普通野生稻与栽培稻的两个亚种之间的亲缘关系最为密切 ;药用野生稻与普通野生稻和与栽培稻的两个亚种的相似性都为 82 % ,说明它与 AA基因组有一定的亲缘关系 ;疣粒野生稻与普通野生稻、药用野生稻和栽培稻两个亚种的亲缘关系相对较远 ,它在稻属中可能是一个系统地位较独特的类群。以 ITS1序列构建的 3种野生稻和 2个栽培稻亚种的系统发育关系与前人用同工酶、叶绿体 DNA、线粒体 DNA和核 DNA资料重建的稻属的系统发育关系基本一致

引用

页码：785 / 791

页数：7

共 10 条

[1]

Molecular phylogeny of the Pooideae （Poaceae） based on nuclear rDNA （ITS） sequences[J] . C. Hsiao,N. J. Chatterton,K. H. Asay,K. B. Jensen.Theoretical and Applied Genetics . 1995 (3)

[2] PHYLOGENETIC ANALYSIS OF SORGHUM AND RELATED TAXA USING INTERNAL TRANSCRIBED SPACERS OF NUCLEAR RIBOSOMAL DNA [J].

SUN, Y ;

SKINNER, DZ ;

LIANG, GH ;

HULBERT, SH .

THEORETICAL AND APPLIED GENETICS, 1994, 89 (01) :26-32

[3]

Mitochondrial DNA RFLP in genus Oryza and cultivated rice[J] . G. Second,Z. Y. Wang.Genetic Resources and Crop Evolution . 1992 (3)

[4]

Polymorphism and phylogenetic relationships among species in the genus Oryza as determined by analysis of nuclear RFLPs[J] . Z. Y. Wang,G. Second,S. D. Tanksley.Theoretical and Applied Genetics . 1995 (5)

[5]

A rapid and inexpensive method for isolation of total DNA from dehydrated plant tissue[J] . Thomas H. Tai,Steven D. Tanksley.Plant Molecular Biology Reporter . 1990 (4)

[6]

Chloroplast DNA diversity in wild and cultivated species of rice （Genus Oryza , section Oryza）. Cladistic-mutation and genetic-distance analysis[J] . A. M. Dally,G. Second.Theoretical and Applied Genetics . 1990 (2)

[7]

Nucleotide sequence of the 17S–25S spacer region from rice rDNA[J] . Fumio Takaiwa,Kiyoharu Oono,Masahiro Sugiura.Plant Molecular Biology . 1985 (6)

[8]

The Wild Relatives of Rice:A Genetic Resources H andbook.Philippines:IRRI,Los Banos,1994 .3 Hilis D M,Dixon M T. Ribosomal DN A:Molecularevolution and phylogenetic inference. Vaughan D A. The Quarterly Review of Biology . 1991

[9]

Modes and tempos in the evolution of nuclear ribosomal DNA: new characters for evolutionary studies and new markers for genetic and population studies. Jorgensen,RA,Cluster,PD. Annals of the Missouri Botanical Garden . 1988

[10]

Ribosom al DNA variation within and am ong plantpopulations. Schaal B A,Learn G H Jr. Annals of the Missouri Botanical Garden . 1988

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