中国驴种线粒体DNA D-loop多态性研究

被引:31
作者
雷初朝
陈宏
杨公社
孙维斌
雷雪芹
葛庆兰
王朝锋
吕宁
高雪
侯文通
机构
[1] 西北农林科技大学动物科技学院,西北农林科技大学动物科技学院,西北农林科技大学动物科技学院,西北农林科技大学动物科技学院,河南科技大学动物科技学院,西北农林科技大学动物科技学院,西北农林科技大学动物科技学院,西北农林科技大学动物科技学院,西北农林科技大学动物科技学院,西北农林科技大学动物科技学院陕西省农业分子生物学重点实验室,杨凌,陕西省农业分子生物学重点实验室,杨凌徐州师范大学生物技术研究所,徐州,陕西省农业分子生物学重点实验室,杨凌,陕西省农业分子生物学重点实验室,杨凌,洛阳,陕西省农业分子生物学重点实验
关键词
家驴; 线粒体DNA; D loop; 多态性; 单倍型; 起源;
D O I
暂无
中图分类号
S822.2 [];
学科分类号
0905 ;
摘要
利用ClustalW软件对我国5个家驴品种26个个体的mtDNAD loop区399bp序列进行同源序列比对,共检测到核苷酸多态位点23个,只有转换1种类型,约占所测核苷酸的5.76%。以欧洲驴D loop作对照,我国5个家驴品种D loop区序列的平均核苷酸变异率为1.80%,其中凉州驴的平均核苷酸变异率为0.35%,云南驴为1.25%,关中驴为2.30%,新疆驴为2.91%,佳米驴为2.20%。家驴品种内与品种间mtDNAD loop区序列歧异度分别为0.25%~5.01%和4.51%~5.51%,说明家驴品种间D loop区序列多态性比较丰富。在所测家驴个体中,mtDNAD loop序列由11种单倍型组成,单倍型比例为42.31%,表明我国家驴mtDNA遗传多态性正逐步丧失,需要加强其种质资源保护。引用GenBank中亚洲野驴和欧洲家驴的序列,构建了我国5个家驴品种的NJ分子系统树,首次从分子水平证实中国家驴可能起源于非洲野驴,而与亚洲野驴无关。
引用
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