人C5aR(CD88)序列结构分析及其B细胞表位预测

被引:27
作者
吕凤林
朱锡华
机构
[1] 第三军医大学免疫学教研室
关键词
结构分析,B细胞表位,C5aR,补体受体;
D O I
10.13431/j.cnki.immunol.j.19980053
中图分类号
R394.2, [];
学科分类号
0710 ; 071007 ;
摘要
采用KyteDoolittle氨基酸亲水性标准及Bairoch的GGBSM方案对人C5aR分子的亲水性基序、B细胞表位及二级结构进行了预测,并用吴氏建立的B细胞表位预测方法进行评述。结果显示,不同的预测方案所得结果一致,人C5aR分子中,构成螺旋结构,伸展构象及无规卷曲的氨基酸残基数比例分别为33.7%,34.6%,31.7%。三个高亲水性区域为第15~18位的DDKD,第195~200位的DKRRER和第330~333位的RESK,其Ah值分别为3.0、3.0、2.32。其平均抗原性指数AI值分别为0.064、0.091、0.070。N-端第9~30氨基酸序列的AI=0.042,是B细胞优势表位区,以此制作短肽单克隆抗体是可行的。
引用
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