用主成分分析探索不同中药组分配伍干预脑缺血的基因表达模式

被引：22

作者：

荆志伟 ^{[1
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周才秀 ^{[1
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王忠 ^{[1
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张占军 ^{[2
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王丽颖 ^{[1
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胡木林 ^{[1
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武红莉 ^{[1
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张亮 ^{[3
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李澎涛 ^{[4
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王永炎 ^{[1
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机构：

[1] 中国中医科学院中医临床基础医学研究所

[2] 北京师范大学认知神经科学与学习国家重点实验室

[3] 生物芯片北京国家工程技术研究中心

[4] 北京中医药大学

来源：

中医杂志 | 2010年 / 51卷 / 02期

关键词：

黄芩苷; 栀子苷; 组分配伍; 脑缺血; 基因芯片; 主成分分析; 细胞黏附;

D O I：

10.13288/j.11-2166/r.2010.02.039

中图分类号：

R285 [中药药理学];

学科分类号：

100806 [中药药理学];

摘要：

目的比较清开灵主要组分黄芩苷、栀子苷及其配伍干预脑缺血损伤的基因表达模式。方法12只4周龄小鼠随机分为黄芩苷组(BA组)、栀子苷组(JA组)、栀子苷+黄芩苷组(BJ组)、尼莫地平组(NM组),建立全脑缺血再灌注小鼠模型后,各组分别给予尾静脉注射黄芩苷、栀子苷、栀子苷+黄芩苷以及尼莫地平。抽提小鼠脑组织的总RNA,制备小鼠全基因组表达谱,对其进行基因本体论功能分类,构建相关系数矩阵,对差异表达的细胞黏附相关基因进行主成分分析。结果获取16463个小鼠脑测全基因组表达谱,筛选出32个差异表达的细胞黏附相关基因。主成分分析结果显示,4组的前2个主成分的累积贡献度为100%,BJ组总得分大于单一组分组,NM组对细胞黏附相关基因干预的总得分高于BA和JA组。各次检测的主成分分布显示,NM组和3个中药组均距离较远,BJ组和BA组的距离均近于JA组。结论黄芩苷、栀子苷及其配伍均能有效干预细胞黏附相关基因,配伍后的干预对黏附相关功能基因的影响大于单一组分组,其基因表达模式和黄芩苷相近。

引用

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页数：4

共 10 条

[1]

Effects of brain-derived neurotrophic factor and neurotrophin-3 on expression of mRNAs encoding c-Fos, neuropeptides and glutamic acid decarboxylase in cultured spinal neurons [J].