水稻Xa21基因在水稻和玉米中的比较物理定位

比较基因组分析证明，禾本科不同种基因组间存在广泛的同线性和共线性。对水稻（ＯｒｙｚａｓａｔｉｖａＬ．）这一模式植物与其它禾本科植物基因的原位杂交比较定位可以揭示禾本科植物基因组结构的共同特点和进化规律。利用含Ｘａ２１基因的ｐＢ８２２作探针筛选水稻的细菌人工染色体（ＢＡＣ）文库，建立了一个包含３个ＢＡＣ克隆的重叠群。用生物素标记其中一个ＢＡＣ克隆，对水稻“广陆矮４号”和玉米自交系黄早四进行了染色体荧光原位杂交。同时，用ｐＢ８２２也作了原位杂交检测。在水稻第１１染色体长臂中间检出了杂交信号，信号与着丝粒的百分距离约为２４。在玉米的第１、３和第８染色体长臂观察到杂交信号，表明玉米基因组中具有三个Ｘａ２１的同源序列座位。ＢＡＣ ＦＩＳＨ的信号检出率达在４０％以上，大大高于质粒探针ｐＢ８２２的检出率（１５％），而且可在同源染色体和姊妹染色单体上同时检出杂交信号的比例较高，证明了利用ＢＡＣ克隆荧光原位杂交进行比较物理定位的可行性和优越性。在ＢＡＣ ＦＩＳＨ中必须用相应基因组的ＣｏｔⅠＤＮＡ封阻，以排除重复序列的干扰。