基于基因表达谱的疾病亚型特征基因挖掘方法

被引:1
作者
徐连彬
王亚东
李霞
杨得印
机构
[1] 哈尔滨工业大学计算机学院
[2] 哈尔滨医科大学生物信息学系 哈尔滨
[3] 哈尔滨
[4] 哈尔滨 哈尔滨医科大学生物信息学系
关键词
基因表达谱; 无监督聚类; 特征基因挖掘;
D O I
暂无
中图分类号
TP399 [在其他方面的应用];
学科分类号
081203 ; 0835 ;
摘要
在本研究中,提出了一种基于基因表达谱的疾病亚型特征基因挖掘方法,该方法基于过滤后基因表达谱,融合无监督聚类识别疾病亚型技术和提出的衡量特征基因对疾病亚型鉴别能力的模式质量测度,以嵌入的方式实现特征基因挖掘。最后将提出的方法应用于40例结肠癌组织与22例正常结肠组织中2000个基因的表达谱实验数据,结果显示:提出的方法是一种可行的疾病亚型特征基因挖掘方法,方法的优势在于可并行实现疾病亚型划分和特征基因识别。
引用
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共 1 条
[1]  
Normalization strategies for cDNA microarrays. Johannes S, Dieter B, Arif M, et al. Nucleic Acids Research, Vol 28(10) . 2000