翘嘴红鲌PEPCK基因的克隆和序列分析

被引:7
作者
戈贤平 [1 ]
俞菊华 [2 ]
吴婷婷 [2 ]
机构
[1] 南京农业大学无锡渔业学院
[2] 中国水产科学研究院淡水渔业研究中心
关键词
基因克隆; 快速扩增cDNA末端; 磷酸烯醇式丙酮酸羧激酶(PEPCK); 翘嘴红鲌; 序列同源性;
D O I
暂无
中图分类号
S917.4 [水产动物学];
学科分类号
0908 ;
摘要
采用RT-PCR和RACE(Rapid Amplification of cDNA Ends)法,分离和克隆翘嘴红(Erythroculter ilishaeformis)磷酸烯醇式丙酮酸羧激酶(PEPCK)基因的全序列,得到2 564 bp[不含poly(A)]的全长cDNA,包括111 bp 5′非翻译区,1 911 bp阅读框以及含Poly(A)信号AATAAA的542 bp3’非翻译区[不包括Poly(A)]。阅读框共编码636个氨基酸,计算的分子量为69.65 kD。该序列含有PEPCK特有的结合草酰乙酯的结构域以及与GTP三磷酸链和Mg2+结合的激酶1和2基序。与其他鱼PEPCK的相似性高达83%96%,和爪蟾、变形虫等其他动物的相似性为50%69%。
引用
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页数:8
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