Taq Man荧光定量RT-PCR快速检测甲3型流感病毒

被引:19
作者
严菊英
卢亦愚
冯燕
史雯
茅海燕
机构
[1] 浙江省疾病预防控制中心病毒研究所
[2] 浙江省疾病预防控制中心病毒研究所 杭州
[3] 杭州
基金
浙江省自然科学基金;
关键词
荧光定量RT-PCR; Taq Man探针; 甲3型流感病毒; 临床标本; 检测;
D O I
暂无
中图分类号
R446.5 [微生物学检验];
学科分类号
100208 ;
摘要
目的建立一种特异、灵敏、快速的荧光定量RTPCR方法用于检测甲3型流感病毒核酸。方法根据GenBank登录的流感毒株序列,应用生物学软件进行序列比对,在甲3型流感病毒血凝素(HA)基因的保守区设计引物和TaqMan探针、并进行筛选。对荧光RT-PCR反应条件进行优化,检测该方法的特异性和灵敏度。并对疑似流感含漱液标本进行检测。结果该方法对甲3型流感病毒的检测有高度的特异性,对甲1型、乙型、禽流感病毒H5、SARS病毒及其他呼吸道病毒均无交叉反应,检测的灵敏度达0.01TCID50,可从疑似流感患者含漱液中直接检测流感病毒核酸,从病毒核酸提取至完成检测仅需3h左右。结论本研究建立的TaqMan荧光定量RTPCR是一种快速检测甲3型流感病毒特异、敏感的新方法。
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