小麦EST-SSRs的通用性研究

被引：17

作者：

李宏伟

刘曙东

高丽锋

贾继增

机构：

[1] 中国农业科学院作物品种资源研究所

[2] 农业部作物种质资源与生物技术重点开放实验室

[3] 西北农林科技大学农学院

[4] 农业部作物种质资源与生物技术重点开放实验室北京

[5] 杨凌

[6] 北京

来源：

植物遗传资源学报 | 2003年 / 03期

关键词：

小麦; EST-SSRs; 通用引物; 功能分类;

D O I：

10.13430/j.cnki.jpgr.2003.03.015

中图分类号：

S512.1 [小麦];

学科分类号：

0901 ;

摘要：

小麦EST SSRs是一种从小麦ESTs序列中开发的新型SSR标记。根据小麦ESTs设计的 5 97对EST SSRs引物在小麦、玉米、水稻和大豆中的有效扩增比率分别为 80 %、6 5 8%、6 2 1%和 5 8 1%。其中 ,2 5 5对EST SSRs引物 (42 7%)在四种作物中都能获得预期产物。序列相似性比较发现 ,2 5 5个通用EST SSRs标记所对应的基因 80 %功能已知 ,其中 30 %与蛋白质定位相关 ,其余 70 %参与细胞代谢、转录调控、细胞发育、防御体系及其他所涉及的生理生化过程。由于不同物种间基因保守性 ,本研究发掘的EST SSRs引物对于小麦功能基因组和比较基因组研究都有重要意义。

引用

页码：252 / 255

页数：4

共 4 条

[1]

Exploiting EST databases for the development and characterization of gene-derived SSR-markers in barley （Hordeum vulgare L.）[J] . T. Thiel,W. Michalek,R. Varshney,A. Graner.Theoretical and Applied Genetics . 2003 (3)

[2]

Assessment of genotypic variation among cultivated durum wheat based on EST-SSRS and genomic SSRS[J] . I. Eujayl,M. Sorrells,M. Baum,P. Wolters,W. Powell.Euphytica . 2001 (1)

[3] Analysis of SSRs derived from grape ESTs [J].

Scott, KD ;

Eggler, P ;

Seaton, G ;

Rossetto, M ;

Ablett, EM ;

Lee, LS ;

Henry, RJ .

THEORETICAL AND APPLIED GENETICS, 2000, 100 (05) :723-726

[4]

Microsatellites and a single-nucleotide polymorphism differentiate apparentamylose classes in an extended pedigree of US rice germ plasm[J] . N. M. Ayres,A. M. McClung,P. D. Larkin,H. F. J. Bligh,C. A. Jones,W. D. Park.TAG Theoretical and Applied Genetics . 1997 (6-7)

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