苏云金杆菌杀虫晶体蛋白活性预测的支持向量机模型

被引：7

作者：

林毅

蔡福营

张光亚

机构：

[1] 华侨大学生物工程与技术系

来源：

生物工程学报 | 2007年 / 01期

关键词：

苏云金杆菌; 均匀设计; 支持向量机; 杀虫晶体蛋白; 杀虫活性预测;

D O I：

10.13345/j.cjb.2007.01.024

中图分类号：

S482.3 [杀虫剂];

学科分类号：

090403 ;

摘要：

藉均匀设计(UD)方法,构建了苏云金杆菌(Bt)杀虫晶体蛋白氨基酸组成特征与其杀虫活性之间关系的支持向量机(SVM)模型。当惩罚系数为0·01、epsilon值为0·2、gamma值为0·05、域值为0·5时,该模型对Bt杀虫晶体蛋白杀虫活性的预测平均准确率达73%。

引用

页码：127 / 132

页数：6

共 3 条

[1] 木聚糖酶氨基酸组成与其最适pH的神经网络模型 [J].

张光亚 ;

方柏山 .

生物工程学报, 2005, (04) :658-661

[2] 基于支持向量机的蛋白质同源寡聚体分类研究 [J].

张绍武 ;

潘泉 ;

陈润生 ;

张洪才 .

生物化学与生物物理进展, 2003, (06) :879-883

[3]

Using the Fisher kernel method to detectremoteproteinhomologies .2 JAAKKOLAT,DIEKHANS D,HAUSSLERD. Proceedingsofthe7thInternationalConferenceonIntelligentSystems for Molecular Biology . 1999

← 1 →