禽流感病毒分离株A/Goose/Guangdong/3/96(H5N1)HA基因序列分析

被引：13

作者：

贾永清

陈化兰

邓国华

唐秀英

田国斌

于康震

刘保全

机构：

[1] 东北农业大学动物医学院!哈尔滨

[2] 中国农业科学院哈尔滨兽医研究所兽医生物技术国家重点实验室!哈尔滨

[3] 中国农业

来源：

中国预防兽医学报 | 2000年 / 01期

关键词：

禽流感病毒; HA基因;

D O I：

暂无

中图分类号：

S852.65 [家畜病毒学];

学科分类号：

090601 ;

摘要：

采用RTPCR技术,以A/Goose/Guangdong/3/96（H5N1）RNA为模板,扩增了1.73kb 的HA 全基因cDNA。将HAcD NA克隆后进行了序列测定,测序结果表明所扩增的1728 个核苷酸片段包含了完整的HA基因的开放阅读框架和上下游引物序列、蛋白质合成的起始密码子和终止密码子。核苷酸序列比较分析结果表明:A/Goose/Guangdong/3/96（H5N1）与A/Goose/Guangdong/1/96（H5N1）有11 个核苷酸差异,同源率99.4% ;与A/HongKong/156/97（H5N1）有25 个核苷酸差异,同源率98.6 % ;与A/Chicken/HongKong/258/97 （H5N1）有30 个核苷酸差异,同源率98.3% ;它们的氨基酸序列同源率依次分别为99 .2 % 、98.6% 和98.1% 。受体结合位点的氨基酸序列完全一致;HA裂解位点氨基酸序列也完全一致,各有5 个碱性氨基酸插入。这说明上述4 个流感病毒分离株可能来自同一个祖先,具有相同的毒力和相似的生物学特性。

引用

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