GENEPOP是一个非常实用的群体遗传学分析软件包 ,适用于对大量的群体遗传学数据进行分析。它主要有以下 3个方面的用途 :1)进行正合检验 ,如对哈迪_温伯格平衡、种群差异和位点间的连锁不平衡进行检验 ;2 )估算经典的群体遗传学参数 ,如Fst和其它相关指数及基因频率等 ;3)可把GENEPOP的输入文件转换为其它常用的群体遗传学分析软件包 (如BIOSYS、FSTAT和LINKDOS)所要求的输入文件格式。与软件BIOSYS相比 ,它在所用的统计学检验方法、适用的群体遗传学研究数据类型及输入文件等方面具有一定的优点