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基因芯片技术在肝癌转移相关基因筛选中的应用
被引：23
作者：
叶青海
汤钊猷
钦伦秀
马曾辰
吴志全
叶胜龙
刘银坤
樊嘉
王心伟
机构：
[1] 复旦大学中山医院、肝癌研究所,复旦大学中山医院、肝癌研究所,复旦大学中山医院、肝癌研究所,复旦大学中山医院、肝癌研究所,复旦大学中山医院、肝癌研究所,复旦大学中山医院、肝癌研究所,复旦大学中山医院、肝癌研究所,复旦大学中山医院、肝癌研究所,美国国立卫生院、癌症研究所上海市,上海市,上海市,上海市,上海市,上海市,上海市,上海市,马里兰州
来源：
关键词：
癌,肝细胞;
基因芯片;
转移;
D O I：
暂无
中图分类号：
R735.7 [肝肿瘤];
学科分类号：
100112 [医学生物化学与分子生物学];
摘要：
目的 在全基因组范围内筛选与肝细胞癌转移相关的基因。方法 采用基因芯片技术比较 2 0例不伴与伴有肝内转移 (门静脉癌栓 )的肝细胞癌之间基因表达谱的差异 ,寻找与肝癌转移相关的基因。基因芯片由美国国立卫生研究院癌症研究所 (NCI)制定 ,每张芯片有 9984个点、含 9180个基因。基因芯片实验采用双色荧光直接标记法 ,每例病人的无瘤肝组织总RNA 10 0 μg用红色荧光素Cy3 dUTP标记 ,其相应肝癌组织总RNA 2 0 0 μg用绿色荧光素Cy5 dUTP标记。混合后与芯片上的基因进行杂交。采用NCI开发的BRB -阵列软件包中先导的“分类比较法”(ClassComparisonTool)对基因芯片资料进行统计分析以寻找伴和不伴转移的肝癌之间表达有差异的基因。结果 伴有转移的肝癌与不伴转移的肝癌之间基因表达谱差异明显 ,在 9180个基因中 2 2 4个基因表达差异有显著性 (P <0 0 0 2 ) ,从中筛选出 36个在两组间差异更加明显、可能与肝癌转移密切相关的候选基因 ,其中许多基因是属于细胞黏附和基质降解方面的 ,如骨桥蛋白 ,alpha 9integrin ,interleukin 2receptor,serineproteinaseinhibitormember 5 ,MMP9,leukocyteimmunoglobulin likereceptorAmember2及CD37antigen等 ,这些基因在肝癌转移过程中可能起了非常重要的作用。结
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