茶树新梢cDNA克隆测序和表达序列标签(ESTs)特性分析

被引:12
作者
陈亮
赵丽萍
高其康
机构
[1] 中国农业科学院茶叶研究所农业部茶叶化学工程重点实验室
[2] 浙江大学分析测试中心 杭州
[3] 杭州
关键词
茶树; cDNA文库; ESTs; 测序; 新基因;
D O I
暂无
中图分类号
S571.1 [茶];
学科分类号
0902 ; 090203 ;
摘要
采用定向克隆法,构建了茶树(Camelliasinensis(L.)O.Kuntze)龙井43和安吉白茶等2个品种新梢cDNA文库。对龙井43cDNA文库共4320个克隆的序列进行了测定,获得有用序列2963个,其中空载体和去除载体后序列短于150bp有416个,重复的有863个,首批共获得1684个茶树ESTs。绝大部分ESTs的长度在300~700bp之间,平均为478bp。通过与NCBI等核酸数据库进行比对、查询和注释,获得已知功能基因或具推测功能的基因130多个(607个ESTs),新的表达基因1077个,证明ESTs测序分析是一个发现和鉴定茶树功能基因的高效快速新途径。
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