穿龙薯蓣、黄山药和盾叶薯蓣psbA-trnH片段序列分析

被引:12
作者
孙华钦 [1 ]
罗科 [1 ]
邹文俊 [2 ]
邓思杨 [2 ]
机构
[1] 中国科学院成都生物研究所
[2] 成都地奥集团
关键词
薯蓣; psbA-trnH序列; 序列分析;
D O I
暂无
中图分类号
S567.239 [];
学科分类号
1008 ;
摘要
为研究薯蓣叶绿体psbA-trnH片段遗传多样性,探讨该片段用于中药穿龙薯蓣、黄山药和盾叶薯蓣种间分子鉴别和系统学研究中的意义,我们对不同类群薯蓣种的叶绿体psbA-trnH基因间区进行PCR扩增并测序,获得了该区间的完整序列,所得序列用软件MEGA3.0进行相关分析.穿龙薯蓣的psbA-trnH片段全长274bp,黄山药全长279bp,盾叶薯蓣植物个体内的叶绿体DNA则有两种psbA-trnH片段,长度分别为241bp和503bp.经MEGA3.0软件分析,3种薯蓣种间psbA-trnH片段序列的遗传距离(p-distance)为0.00350~0.04545,各个薯蓣种内的不同类群该序列无差异.用UPGMA法根据psbA-trnH序列的遗传距离建立系统发生树,聚类结果和形态分类相符.所得结果显示,psbA-trnH片段序列在所研究的3种薯蓣种内保守,在种间具有明显的较大差异,而3种薯蓣及薯蓣属的系统发生关系尚须进一步研究.图3表2参6
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共 2 条
[1]  
药用薯蓣栽培[M]. 四川科学技术出版社 , 周瑾,李伯刚编著, 2003
[2]  
A molecular phylogeny of the genus Gagea (Liliaceae) in Germany inferred from non-coding chloroplast and nuclear DNA sequences[J] . A. Peterson,H. John,E. Koch,J. Peterson.Plant Systematics and Evolution . 2004 (3)