判定直系同源关系的进化分析方法

被引：3

作者：

时硕永

丁达夫

机构：

[1] 中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所

[2] 中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所上海

[3] 上海

来源：

生物化学与生物物理学报 | 2002年 / 01期

基金：

国家自然科学基金重大项目;

关键词：

直系同源; 旁系同源; 进化分析; 比较基因组学;

D O I：

暂无

中图分类号：

Q343.2 [染色体理论（染色体遗传学）];

学科分类号：

071007 ; 090102 ;

摘要：

如何正确判定基因之间的直系同源 (ortholog)和旁系同源 (paralog)关系 ,仍是基因组功能诠释和比较基因组学中有待更好解决的关键问题。在以前的工作中 ,曾用进化分析方法解决多基因家族的直系 /旁系同源关系的判定问题 ,现进而完整地展开判定直系同源关系的进化分析方法。从 44个同源蛋白质家族的案例观察表明 ,与流行的COG方法 (直系同源蛋白质的聚类 )比较 ,本方法能一般的判定直系同源关系以及能准确的诠释基因组的分子功能

引用

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