DNA条形码识别Ⅵ:基于微型DNA条形码的果实蝇物种鉴定

被引：24

作者：

范京安 ^{[1
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顾海丰 ^{[2
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陈世界 ^{[1
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莫帮辉 ^{[3
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温演庆 ^{[1
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何万兴 ^{[1
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刘伟 ^{[1
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曾晓茂 ^{[2
]}

机构：

[1] 四川出入境检验检疫局

[2] 中国科学院成都生物研究所

[3] 中国科学院成都计算机应用研究所

来源：

应用与环境生物学报 | 2009年 / 15卷 / 02期

关键词：

实蝇科; COI基因; DNA条形码; 微型DNA条形码; 物种鉴定;

D O I：

暂无

中图分类号：

S41 [植物检疫];

学科分类号：

0904 ;

摘要：

选用双翅目实蝇科12属36种55个样本为材料,将其DNA条形码(mtDNACOI基因648bp)与微型DNA条形码(mtDNACOI基因50～200bp)数据进行比较分析,探讨微型DNA条形码对果实蝇物种鉴定的可行性.采用虚拟实验(Silico analysis),将BOLD数据库中49个样本的序列分别拆成648bp、160bp、50bp三个片段,通过构建NJ树,并进行遗传距离分析,得出每个片段鉴定物种的准确性依次为100%、94%、84%.同时做了实体实验(Empirical test),得到了果实蝇属6个物种的COI序列,将其与虚拟实验中的49个样本序列合并,以DNA-barcode指定序列5’端160bp序列为分析基础,通过遗传距离分析,得出其鉴定物种的准确性为94%,验证了虚拟实验结果.即微型DNA条形码(Minimalistbarcode)鉴定果实蝇物种的准确性与DNA条形码基本一致,均可作为果实蝇物种鉴定的有效依据.图2表1参29附1

引用

页码：215 / 219

页数：5

共 9 条

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