OPLS方法的原理及其在代谢组学数据判别分析中的应用

被引:37
作者
李俊南
侯艳
孙凤宇
李康
机构
[1] 哈尔滨医科大学卫生统计学教研室
关键词
orthogonal projection to latent structures(OPLS); 模型拟合; 可视化; 代谢组学;
D O I
暂无
中图分类号
R195.1 [卫生统计学];
学科分类号
100401 [流行病与卫生统计学];
摘要
目的探讨orthogonal projection to latent structures(OPLS)方法的原理、特点及其在代谢组学高维数据分析中的应用。方法通过R语言编程实现OPLS方法,利用模拟试验探索OPLS的特性及适用条件,并通过实际数据进行验证。结果利用一个OPLS预测主成分的模型拟合效果与利用偏最小二乘(PLS)多个主成分的模型拟合效果相同,同时具有较好的判别能力,其得分图的可视化效果优于PLS。结论 OPLS能够有效去除自变量矩阵X中与因变量Y无关的信息,使模型变得简单、易于解释,同时具有较好的可视化效果,可有效地用于代谢组学数据分析中。
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页码:765 / 769
页数:5
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