保护地根结线虫发生地土壤微生物群落多样性的研究

被引:7
作者
刘玮琦
茆振川
杨宇红
谢丙炎
机构
[1] 中国农业科学院蔬菜花卉研究所
关键词
根结线虫; 细菌; 放线菌; 16SrRNA基因克隆文库; 系统发育分析;
D O I
10.16409/j.cnki.2095-039x.2008.04.005
中图分类号
S432.45 [];
学科分类号
090401 ;
摘要
采用未培养技术直接从根结线虫保护地土壤样品中提取微生物总DNA,分别构建土壤细菌和放线菌的16S rRNA基因克隆文库,通过HinfⅠ和HaeⅢ限制性内切酶分别对两个基因文库中的克隆进行ARDRA分析,构建细菌和放线菌克隆文库的系统发育树,分析主要种群的组成。结果表明:根结线虫保护地土壤细菌种群主要包括α、γ、β变形细菌亚群,拟杆菌门,放线菌门等类群,其中能引起植物根癌病的根癌农杆菌所占比例较大。放线菌种群大约83.4%的克隆属于放线菌亚纲,放线菌亚目,包括微球菌亚目、小单胞菌亚目、丙酸杆菌亚目、棒状杆菌亚目和链孢囊菌亚目等,其余为未分类放线菌种类。
引用
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