长春地区幽门螺杆菌 cagA基因及EPIYA基序多态性分析

被引:5
作者
范聪聪 [1 ]
王丽波 [2 ]
江海洋 [1 ]
赵亚楠 [1 ]
武晓琳 [1 ]
赵春燕 [1 ]
机构
[1] 长春, 吉林大学基础医学院病原生物学系
[2] 长春, 吉林大学第一医院胃肠内科
关键词
幽门螺杆菌; 毒力基因cagA; EPIYA基序;
D O I
暂无
中图分类号
R378 [病原细菌];
学科分类号
100103 [病原生物学];
摘要
目的研究长春地区就医人群中幽门螺杆菌(Helicobacter pylori, Hp)毒力基因cagA携带率及其3′端编码CagA蛋白EPIYA基序多态性, 并探讨其结构特征的差异与疾病的关系。方法 PCR法扩增临床分离株Hp的cagA基因并测序, DNAMAN软件将测序后的核苷酸序列翻译成氨基酸序列, 然后利用软件MEGA6.0对测序Hp的cagA基因碱基和蛋白质氨基酸序列进行多重对比分析和构建系统发育进化树。结果收集298例胃黏膜标本, 共分离60株Hp菌株。Hp检出率与性别和年龄无关(P>0.05), 消化性溃疡(PUD)组的Hp分离率高于非溃疡性消化不良(NUD)组(P<0.05)。cagA基因阳性率为90%(54/60)。其中成功测序的26株中, 23株为东亚型, 占88.4%;3株为西方型, 占11.6%。东亚型菌株中22株为EPIYA-ABD, 1株为EPIYA-ABBD;西方型菌株中, 2株为EPIYA-ABC, 1株为EPIYA-BC。经构建进化树发现, 序列聚类为东亚型群和西方型群两大类, 在东亚型群中疾病分布并没有出现明显聚集, 西方型群均来自PUD组。4株来自PUD组的Hp发生了氨基酸突变且均发生在EPIYA-B这个片段。结论本地区分离的Hp cagA基因阳性率为90%, 分布与胃肠疾病类型无关;EPIYA分型以毒力强的东亚型EPIYA-ABD型为主(84.6%, 22/26)。EPIYA-B片段氨基酸突变与消化性溃疡密切相关;cagA 3′端DNA序列变化不大, 没有明显的地区聚集性。
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