【目的】利用26S rDNA D1-D3区序列差异鉴别鸡血藤及其混淆品。【方法】使用改良十六烷基三甲基溴化铵(CTAB)法提取鸡血藤及其混淆品的总DNA,选择浓度较高的样品作为模板DNA,对26S rDNA D1-D3区进行PCR扩增、测序和序列比对分析。【结果】获得26S rDNA D1-D3区长约700 bp的序列。比对结果显示,不同产地之间鸡血藤的序列一致率为96%和100%,混淆品与正品比较的序列一致率为80%~96%。在26S rDNA D1-D3区384~472 bp的位置有足够的碱基差异位点用以区分鸡血藤及其混淆品。【结论】26S rDNA D1-D3区序列可以应用于鉴别鸡血藤及其混淆品。