新分离登革2型病毒福建株基因组全序列的测定附视频

目的　对新近分离的导致 1999年福建省登革热流行的登革 2型病毒FJ 10株进行基因组全序列测定及系统发生树分析。方法　利用RT PCR和 5′、3′RACE法扩增FJ 10株cDNA ,并进行克隆测序。利用DNASTAR软件的Clustal方法绘制系统发生树。结果　FJ 10株基因组全长 10 72 3个核苷酸 ,有 1个单一开放读码框架 (ORF ,第 97～ 10 2 6 9nt) ,编码 3391个氨基酸 ,5′和 3′非编码区长度分别为 96和 45 4个核苷酸。通过与标准株NGC株和我国其他地区分离株DEN2 0 4、43、44株比较 ,核苷酸同源性分别为 94.0 %、92 .8%、93.9%和 93.9% ,氨基酸同源性分别为 97.9%、97.2 %、97.7%和97.9%。以 47株登革 2型病毒E/NS1连接区 2 40个核苷酸序列进行系统发生树分析 ,福建株与印度尼西亚和斯里兰卡分离株亲缘关系较近 ,同属于第Ⅳ基因型。结论　FJ 10株基因组全序列一级结构与其他登革 2型病毒类似 ,其基因型不同于我国其他地区分离株DEN2 0 4、43和 44株。