DNA条形码序列对9种蒿属药用植物的鉴定

被引:38
作者
刘美子 [1 ,2 ]
宋经元 [1 ]
罗焜 [1 ]
林余霖 [1 ]
刘萍 [2 ]
姚辉 [1 ]
机构
[1] 中国医学科学院 北京协和医学院药用植物研究所,濒危药材繁育国家工程实验室
[2] 天津中医药大学
基金
高等学校博士学科点专项科研基金;
关键词
蒿属; DNA条形码; ITS2; PCR扩增; 遗传距离;
D O I
暂无
中图分类号
S567 [药用作物];
学科分类号
090104 [作物信息科学与技术];
摘要
目的采用DNA条形码序列对9种常见的蒿属药用植物进行鉴定,为常见蒿属药用植物的鉴定提供分子依据。方法对9种常见蒿属药用植物的4条候选DNA条形码序列(ITS2、rbcL、matK、psbA-trnH)进行PCR扩增和测序,比较各序列的扩增和测序效率,应用BLAST1、Distance方法来评估各序列的鉴定效率。此外,基于MEGA5分析9种常见蒿属药用植物ITS2序列种间K2P遗传距离并构建NJ树。结果除matK外,其余3条片段的PCR扩增和测序效率均为100%,ITS2序列对9种蒿属药用植物的物种水平鉴定成功率最高,为100%,而psbA-trnH、rbcL、matK、matK+rbcL的鉴定成功率(BLAST1法)分别为83.3%、66.7%、54.5%、75%。通过ITS2序列的种间K2P遗传距离及NJ树均能将不同物种全部区分。结论 ITS2序列可以作为鉴定蒿属药用植物的潜在条形码。
引用
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