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用聚类法分析受抗真菌物质处理后的酵母细胞全基因表达谱附视频
被引：4
作者：
张亮
张岩
周一鸣
安爽
果德安
周玉祥
曾令文
程京
机构：
[1] 清华大学生物科学与技术系
[2] 生物芯片北京国家工程研究中心
[3] 北京大学天然药物及仿生药物国家重点实验室
[4] 清华大学生物科学与技术系 生物芯片北京国家工程研究中
来源：
关键词：
微阵列DNA芯片;
抗真菌药物;
聚类分析;
D O I：
暂无
中图分类号：
Q78 [基因工程（遗传工程）];
学科分类号：
071007 ;
0836 ;
090102 ;
摘要：
微阵列DNA芯片技术可以并行分析成千上万个基因的表达情况 ,它为研究药物的作用机制提供了一个新的高效技术平台 .用 9种已知和未知作用机理的抗真菌化合物处理酵母细胞 ,并得到酵母细胞的全基因表达谱 ,然后对其进行聚类分析 .结果表明作用机制类似的化合物具有相近的聚类关系 .两性霉素B和制霉菌素、酮康唑和克霉唑都是已知的作用机制类似的抗真菌药物 .通过对基因表达谱进行聚类分析 ,发现前一组和后一组分别被聚类在一起 .另外已知澳洲茄胺抑制的是细胞膜上麦角固醇的合成 ,聚类分析表明它与酮康唑 ,克霉唑的聚类很靠近 .对微阵列DNA芯片产生的基因表达谱进行聚类分析 ,由于作用机制相似的药物会被聚类在一起 ,因此根据未知药物和已知药物的聚类关系 ,可以了解未知药物的作用机制 ,这对于加速新药开发的步伐具有十分重要的意义
引用
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