取3个不侵染马铃薯的番茄晚疫病菌菌株和3个不侵染番茄的马铃薯晚疫病菌菌株,以及2个可交叉侵染马铃薯和番茄的菌株,提取DNA全基因组后,用引物ITS1和ITS4进行扩增,得到约850bp左右的扩增产物并进行测序,比较同源性,结果显示这些菌株的全基因组DNA序列与Genebank上登录的3个序列AF228084,AF228083,AY269995 1的同源性均为100%。3个番茄菌株之间的同源性大小为98 22%,3个马铃薯菌株之间的为99 52%,较番茄菌株的同源性高。不可交叉的两类菌株间的同源性为98 28%,可交叉侵染的番茄菌株和马铃薯菌株之间的同源性为99 17%,比不可交叉侵染的菌株间的同源性高,说明相似的序列使得生物学特性也很相似,反之,同源性有差异的,在生物特性上也表现出一定差异。