我国云南德宏地区HIV感染者HIV毒株膜蛋白基因的序列测定和分析

１９９０年和１９９３年，从云南瑞丽县感染ＨＩＶ的静脉注射毒品者中采血，分离白细胞，用ＰＣＲ方法扩增ＨＩＶ１膜蛋白基因（ｅｎｖ）并克隆。核苷酸序列分析由手工和ＡＢＩ公司ＤＮＡ序列分析仪进行。将云南瑞丽ＨＩＶ毒株的ｅｎｖＶ３－Ｖ５区序列与国际各亚型同源序列作比较，９０年和９３年ＨＩＶ毒株与Ｂ亚型的同源性均为最高。这表明云南瑞丽流行的ＨＩＶ毒株属国际Ｂ亚型。经分析发现，在９０年的１０个毒株的序列中，有８个是典型的Ｂ亚型序列，即Ｖ３环顶端的四肽是ＧＰＧＲ，占８０％；而在９３年的毒株中，该型序列只见于２１个样品中的１２个，比例下降到５７％。与此同时，Ｖ３环顶端四肽为ＧＰＧＱ的Ｂ亚型中的泰国基因型序列，则由９０年的１０％（１／１０）上升到９３年的２９％（６／２１）。进一步分析编码ＧＰＧＲ最末一个精氨酸密码子发现，ＣＧＡ与ＡＧＡ比例由９０年的１：７上升到９３年的５：７。由于ＣＧＡ比ＡＧＡ更接近编码谷氨酰胺（Ｑ）密码子ＣＡＡ，这种以ＧＰＧＱ为特征的泰国基因型Ｂ亚型毒株，在该地区还可能进一步增高。这些数据提示，当地流行的ＨＩＶ毒株Ｖ３环顶端的四肽在过去几年中由ＧＰＧＲ向ＧＰＧＱ漂移，其原因尚不清楚。