东北虎粪细菌区系的16S rRNA基因序列分析

为研究东北虎粪微生物区系建立了东北虎粪细菌的16SrDNA文库。通过EcoRⅠ和HindⅢ分别对阳性克隆进行酶切分析,从东北虎的16SrDNA文库中分别获得了15个具有酶切差异的克隆。BLAST分析结果显示,在15个克隆中,10个克隆与梭菌属成员有97%以上的同源性,其中有6个序列与诺维梭菌A型（Clostridiumnovyitype A）有99%的同源性,为诺维梭菌A型;4个序列与猪粪细菌RT-18B（Swine manure bacteriumRT-18B）有97%的同源性,为消化链球菌属（Peptostreptococcus）成员。其它序列与GenBank中登录的序列同源性低于97%,为5种未培养细菌,其中4种16SrRNA基因序列分别与Clostridiumpascui、破伤风梭菌E88（ClostridiumtetaniE88）、梭菌（Clostridiumsp.）14505及产气荚膜梭菌（Clostridiumperfringens）有94%95%的相似性。第5种与肉杆菌（Carnobacteriumsp.）R-7279株有94%的同源性。