采用PCR-DGGE技术分析蛋鸡肠道细菌种群结构及多样性

被引:54
作者
倪学勤 [1 ]
Joshua Gong [2 ]
Hai Yu [2 ]
曾东 [1 ]
Shayan Sharif [3 ]
周小秋 [4 ]
机构
[1] 四川农业大学动物医学院动物疫病与人类健康四川省重点实验室
[2] Food Research Program,Agriculture and Agri-Food Canada
[3] Depart ment of Pathobiology,University of
关键词
蛋鸡; 肠道菌群; 变性梯度凝胶电泳(DGGE); 多样性;
D O I
暂无
中图分类号
S852.6 [家畜微生物学(兽医病原微生物学)];
学科分类号
摘要
利用基于16S rDNA的PCR-DGGE(变性梯度凝胶电泳)图谱技术结合特异性和共性条带割胶回收DNA进行克隆和测序,对2、4、6和8周龄蛋鸡嗉囊、十二指肠、空肠、回肠和盲肠内容物细菌群落的结构和多样性进行了比较,并鉴定了8周龄蛋鸡部分特异性和共性群落成员,分析蛋鸡年龄和肠段部位对微生物群落结构和多样性的影响。肠道菌群DGGE图谱显示肠道部位对细菌种群结构影响很大,盲肠内微生物的多样性最高,其次是回肠和空肠,嗉囊和十二指肠的微生物多样性比较低。十二指肠内细菌与其它肠段相比差异最大,其次是盲肠与其它肠段细菌组成的差异。随着蛋鸡周龄的增加,消化道微生物经历了由简单(2周)到复杂(4周),再回复简单(6周)到复杂(8周)的变化过程。DGGE图谱中共性条带序列分析表明8周龄蛋鸡消化道前段的优势细菌是三得利乳杆菌(Lactobacillus suntoryeus)、索氏梭菌(Clostridium sordellii)和大肠杆菌,盲肠中的特异性条带主要是各种不可培养的细菌以及超巨巨单胞菌(Megamonas hypermegale)和梭菌属细菌(Clostridiumspp)。该研究结果表明蛋鸡肠道部位决定细菌群落的结构和多样性,蛋鸡的周龄影响肠道细菌多样性。
引用
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共 3 条
  • [1] Spatial and temporal variation of the intestinal bacterial community in commercially raised broiler chickens during growth
    van der Wielen, PWJJ
    Keuzenkamp, DA
    Lipman, LJA
    van Knapen, F
    Biesterveld, S
    [J]. MICROBIAL ECOLOGY, 2002, 44 (03) : 286 - 293
  • [2] The intestinal flora of the chicken in the period 2 to 6 weeks of age, with particular reference to the anaerobic bacteria[J] . Ella M. Barnes,G. C. Mead,D. A. Barnuml,E. G. Harry.British Poultry Science . 1972 (3)
  • [3] Probiotics, the Scientific Basis. Barrow P. Chapman & Hall . 1992