H5N1虎源流感病毒荧光定量RT-PCR检测方法的建立及临床应用

被引:6
作者
侯小强 [1 ]
夏咸柱 [2 ]
高玉伟 [1 ]
薛琳 [1 ]
王铁成 [2 ]
机构
[1] 吉林大学畜牧兽医学院
[2] 解放军军事医学科学院军事兽医研究所
关键词
H5N1虎源流感病毒; 荧光定量RT-PCR; 检测方法;
D O I
暂无
中图分类号
S854.43 [];
学科分类号
0906 ;
摘要
根据本室分离获得的虎源H5N1流感病毒的HA基因序列测定结果,结合GenBank中报道的H5亚型禽流感病毒HA基因序列进行同源性比较分析,选择保守序列区作为扩增区域,利用Primer5·0引物设计软件和BLAST软件程序设计出特异性扩增引物。采用成本较低、不需要特异探针引物、优化周期短,能区分病毒变异株的SYBRGreenI随机掺入法建立定量PCR反应体系,并对反应条件进行优化。试验结果表明应用该方法对虎源H5流感病毒的检测具有高度的特异性,检测的灵敏度为101~102拷贝数。对20份病死老虎临床病料和24份人工感染的小鼠脏器病料用荧光定量RT-PCR方法、常规RT-PCR方法和病毒分离方法进行检测,荧光定量RT-PCR方法检测结果略高于常规RT-PCR方法,但与病毒分离方法结果相一致。这说明荧光定量RT-PCR方法可以对临床上H5N1虎源流感病毒检测提供参考。
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