赤霉素诱导甘蔗节间伸长基因的cDNA-SCoT差异表达分析

被引：40

作者：

吴建明 ^{[1
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李杨瑞 ^{[1
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王爱勤 ^{[3
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杨柳 ^{[1
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杨丽涛 ^{[3
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机构：

[1] 广西甘蔗研究所

[2] 广西作物遗传改良生物技术重点开发实验室

[3] 广西大学广西亚热带生物资源保护利用重点实验室

[4] 中国农业科学院甘蔗研究中心

来源：

作物学报 | 2010年 / 36卷 / 11期

关键词：

赤霉素; 甘蔗; cDNA-SCoT; 差异表达;

D O I：

暂无

中图分类号：

S566.1 [甘蔗];

学科分类号：

090302 [植物营养学];

摘要：

以甘蔗ROC22为材料,在伸长初期进行叶面喷施200mgL?1浓度的赤霉素为处理,以喷施清水为对照,在不同时间取幼茎样品,用cDNA-SCoT进行基因差异表达分析。结果表明,通过46条引物筛选了约700个cDNA片段,获得差异片段30个。有18个基因片段受赤霉素上调而12个基因片段下调;其中16个TDFs序列和NCBI数据库中已录入的基因具有较高的相似性,按照其功能可分为6类,即能量与代谢相关基因(占总数的20.0%)、未知功能蛋白(占总数的20.0%)、未知基因(占总数的46.7%)、信号传导相关基因(占总数的6.7%)、转录因子相关基因(占总数的3.3%)和细胞凋亡基因(3.3%)。这说明利用SCoT方法可以进行蔗茎基因差异表达研究,分离到的一些差异片段可能是与甘蔗节间伸长相关的基因。

引用

页码：1883 / 1890

页数：8

共 9 条

[1]

赤霉素诱导甘蔗节间伸长与内源激素变化的关系 [J].