三种土壤微生物总DNA提取方法的比较

被引:12
作者
王丽娜 [1 ,2 ]
许修宏 [1 ]
宛煜嵩 [2 ]
金芜军 [2 ]
机构
[1] 东北农业大学生命科学学院
[2] 中国农业科学院生物技术研究所
关键词
土壤微生物; DNA提取; DGGE;
D O I
暂无
中图分类号
S154.3 [土壤微生物学];
学科分类号
摘要
本文对3种常用的土壤微生物总DNA提取方法Martin法、高盐改进法及试剂盒法进行了比较,并通过DNA得率、纯度及16S rDNA V3可变区的PCR扩增结合DGGE法(denaturinggradient gel electrophoresis),分别对3种方法进行评价。结果表明,3种方法提取的DNA均能满足土壤微生物多样性分析的要求。其中试剂盒方法操作简单,提取的DNA质量较高,但DNA得率较低且成本昂贵。Martin法和高盐改进法用时较长,DNA得率较高,纯度较低,但对后续PCR扩增和DGGE分析没有明显影响,且成本低廉。
引用
收藏
页码:331 / 334
页数:4
相关论文
共 4 条
  • [1] 土壤微生物总DNA的提取和纯化
    张瑞福
    曹慧
    崔中利
    李顺鹏
    樊奔
    [J]. 微生物学报, 2003, (02) : 276 - 282
  • [2] Comparison of rapid DNA extraction methods applied to contrasting New Zealand soils
    Lloyd-Jones, G
    Hunter, DWF
    [J]. SOIL BIOLOGY & BIOCHEMISTRY, 2001, 33 (15) : 2053 - 2059
  • [3] Extraction and purification of DNA in rhizosphere soil samples for PCR-DGGE analysis of bacterial consortia
    Niemi, RM
    Heiskanen, I
    Wallenius, K
    Lindström, K
    [J]. JOURNAL OF MICROBIOLOGICAL METHODS, 2001, 45 (03) : 155 - 165
  • [4] Heteroduplexes in mixed-template amplifications:formation,consequence and elimination by ‘reconditioning PCR‘ .2 Thompson,J.R,Marcelino,L.A,Polz,M.F. Nucleic Acids Research . 2002