福建省甲型H1N1流感病毒分离及首例分离株全基因组序列分析

被引：19

作者：

谢剑锋

沈晓娜

王美爱

张拥军

吴冰珊

陈炜

王金章

修文琼

朱莉莉

杨式芹

陈端

翁育伟

郑奎城

严延生

机构：

[1] 福建省疾病预防控制中心

来源：

中国人兽共患病学报 | 2009年 / 25卷 / 08期

关键词：

甲型H1N1流感; 病毒分离; 全基因组序列; 序列分析; 进化树;

D O I：

暂无

中图分类号：

R373 [人体病毒学（致病病毒）]; S852.65 [家畜病毒学];

学科分类号：

090507 [智慧养殖与动物生产学]; 100123 [人体微生态学];

摘要：

目的分离甲型H1N1流感病毒,分析福建省首例病毒分离株全基因组序列和遗传特征,为研究病毒进化、致病性、流行规律提供科学依据。方法采用MDCK细胞和Real-time PCR法进行病毒分离、鉴定;提取病毒RNA,通过RT-PCR扩增其8个基因片段,测定核苷酸序列,利用生物信息软件拼接全基因组序列;分析重要基因位点,利用GENBANK中相关序列对首例病毒分离株A/Fujian/01/2009(H1N1)进行基因进化树分析。结果从82例甲型H1N1流感确诊病例标本中分离出50株甲型H1N1流感病毒,第一代分离阳性率60.98%。在福建省首次获得甲型H1N1流感病毒株及全基因组序列。基因组序列分析证明:该毒株与2009年大流行株高度同源,其基因组存在四源重组现象;氨基酸位点分析其对达菲药物敏感,对金刚烷胺类药物耐药;相对于猪流感代表株A/Swine/Iowa/15/1930(H1N1)存在6个HA抗原决定簇位点变异。结论MD-CK细胞对甲型H1N1流感病毒具有较高敏感性;福建省首例甲型H1N1流感病例分离病毒株与北美流行株高度同源;相对于以往古典型猪流感代表株出现了HA蛋白抗原性漂移;为今后进一步开展甲型H1N1流感病毒分子生物学研究奠定基础。

引用

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