1986-1987年首次全面调查了宁夏沙坡头自然保护区的动物种类及其数量。为了解1986年以来保护区动物资源的消长变化及其原因,1998-1999年又4次调查了该地脊椎动物种类及数量。10多年来沙坡头自然保护区的动物资源变化明显。 1999年国家重点保护动物比 1986年增加 7种,已达 19种,其中国家Ⅰ类保护种类 3种,Ⅱ类保护种类 16种。鸟类增加 35种,其中宁夏新记录11种;兽类新增 3种;两栖类和爬行类各减少 2种;鼠类减少 3种。1999年与1986年相比,湿地景观水鸟种类和数量显著增加,村庄农田景观、荒漠景观和固沙林景观鸟类种类和数量减少。环境指示种类纵纹腹小■(Athene noctua)、黑顶麻雀(Passer ammodendri)、树麻雀(Passer montanus)、凤头百灵(Calerida cristata)、大杜鹃(Cuculus canorus)、山斑鸠(Streptopelia orientalis)等种群数量明显减少。鼠类不但种类减少,数量也明显下降。影响动物种类、数量发生变化的主要因素是由于病虫害、人类对土地开发利用和生产活动引起的防风固沙林面积减少;地下水位下降;水环境污染严重,水质变坏和富营养化;草甸、草原覆盖度下降,草场退化;农田和鱼塘面积扩大。