紫云英SSR分子标记的开发及在品种鉴别中的应用

被引：14

作者：

陈坚 ^{[1
]}

张辉 ^{[2
]}

朱炳耀 ^{[1
]}

林新坚 ^{[2
]}

机构：

[1] 福建省农业科学院生物技术研究所

[2] 福建省农业科学院土壤肥料研究所

来源：

作物学报 | 2011年 / 37卷 / 09期

关键词：

紫云英; 微卫星序列(SSR); 遗传多样性; 链霉素亲和磁珠; 品种鉴别;

D O I：

暂无

中图分类号：

S551.9 [];

学科分类号：

摘要：

利用生物素标记的(AG)15、(CT)15、(AC)15、(GT)15探针及链霉素亲和磁珠,从紫云英的基因组中富集微卫星(SSR)序列。在用富集片段构建插入文库的950个转化子中,经PCR检测及测序共得到127个SSR序列,微卫星序列的富集效率达15.8%。除去重复或无效的序列,得到33个序列用于引物设计。对征集的9个紫云英品种进行多态性分析,有6对引物扩增出明显且稳定的多态性位点18个。在紫云英的品种水平上,这些SSR位点产生的多态率为50%～100%,有效等位基因数为1.19～1.64,Nei氏遗传多样性为0.13～0.38,Shannon多态信息指数为0.22～0.56;利用这6对引物可将参试品种完全区分开,证明这些SSR位点可用于紫云英品种的指纹鉴别。根据SSR位点的相似性系数,将9个紫云英品种主要聚成两个类群,与传统按生育期的紫云英品种划分结果无必然的联系。

引用

页码：1592 / 1596

页数：5

共 10 条

[1] 五个紫云英地方品种比较试验 [J].

陈云峰 ;

李双来 ;

乔艳 ;

胡诚 ;

刘国际 .

湖北农业科学, 2009, 48 (12) :2989-2992

[2] 植物SSR引物开发策略简述 [J].

陈怀琼 ;

隋春 ;

魏建和 .

分子植物育种, 2009, 7 (04) :845-851

[3] 核桃EST-SSR信息分析与标记的初步建立 [J].

朱艳 ;

郝艳宾 ;

王克建 ;

吴春林 ;

王维霞 ;

齐建勋 ;

周军 .

果树学报, 2009, 26 (03) :394-398

[4] 芝麻EST-SSR标记的开发和初步研究 [J].

魏利斌 ;

张海洋 ;

郑永战 ;

郭旺珍 ;

张天真 .

作物学报, 2008, 34 (12) :2077-2084

[5] 亲和素磁珠分离毛竹SSR标记方法的优化 [J].

苗元 ;

李潞滨 ;

唐征 ;

杨凯 ;

刘贯水 ;

朱宝成 .

河北农业大学学报, 2008, (03) :51-55

[6] 磁珠富集法筛选马尾松微卫星标记 [J].

李炟 ;

季孔庶 ;

龚佳 .

分子植物育种, 2007, (01) :141-144

[7] 一种利用ISSR开发SSR引物的方法 [J].

郭大龙 ;

罗正荣 .

植物生理学通讯, 2006, (02) :268-270

[8] 稻田紫云英肥饲兼用的技术与效益 [J].

吴建富 ;

张美良 ;

刘经荣 ;

张德远 .

江西农业大学学报, 1997, (02) :55-58

[9] Assignment of allelic configuration in polyploids using the MAC-PR (microsatellite DNA allele counting-peak ratios) method [J].

Esselink, GD ;

Nybom, H ;

Vosman, B .

THEORETICAL AND APPLIED GENETICS, 2004, 109 (02) :402-408

[10]

Microsatellite molecular markers enrichment and isolation by magnetic beads （FIASCO protoco1）in genome of lotus （Nelumbo nucifera Gaertn）. Pan L,Zheng P,Xu J,Quan Z-W,Li S-M,Liu H-G,Ke W-D,Ding Y. China Veget . 2007

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