利用生物信息学方法筛选一组胃癌相关EST特征序列

被引：4

作者：

邢军

徐垚

刘文天

郑洁

李艳芸

机构：

[1] 天津医科大学实验中心

[2] 天津医科大学实验中心天津

[3] 天津

来源：

天津医科大学学报 | 2004年 / 01期

关键词：

差异显示; EST; 生物信息学;

D O I：

暂无

中图分类号：

R735.2 [胃肿瘤];

学科分类号：

100112 [医学生物化学与分子生物学];

摘要：

目的 :以生物信息学为研究方法 ,利用互联网基因组资源 ,对一组胃癌相关差异显示逆转录聚合酶链式反应方法获得的差异表达片段进行序列分析。方法 :使用BLAST软件 ,将所得到的6条序列与EST数据库和基因组数据库进行比对分析 ,以期获得序列的特征信息 ,并筛选出有意义的EST序列。结果 :显示有3条序列与非编码区长散布核元件LINE区域匹配 ;1条序列与CD9的外显子同源 ;1条为新的EST序列 ,已提交EST数据库并获得序列登陆号 ;1条序列尚须通过基因识别的方法进一步证实其特性。结论 :通过生物信息学方法快速筛选获得胃癌相关已知EST序列1条 ,获得1条新EST序列 ,排除3条DNA污染序列

引用

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