木质素合成酶C3H基因的生物信息学分析

被引：24

作者：

薛永常

聂会忠

刘长斌

机构：

[1] 大连工业大学生物与食品工程学院辽宁省发酵工程重点实验室

来源：

生物信息学 | 2009年 / 7卷 / 01期

关键词：

香豆酸-3-羟基化酶; 生物信息学; 分子进化;

D O I：

暂无

中图分类号：

Q943 [植物细胞遗传学];

学科分类号：

071007 ; 090102 ;

摘要：

应用生物信息学的方法对GenBank中拟南芥、火炬松、胡麻、紫花罗兰等植物香豆酸-3-羟基化酶(c3h)基因以及本实验室克隆的欧美杨107的c3h基因(AM920690)核苷酸序列以及翻译的氨基酸序列的组成成分、导肽、跨膜结构域、疏水性/亲水性、蛋白质二级结构及功能域等进行了初步分析预测。分析表明欧美杨107的C3H氨基酸序列不存在导肽,无跨膜结构域,肽链表现为亲水性;二级结构域与P450高度匹配,其高级结构中含有由含铁血红素和半胱氨酸组成的活性中心,并构建了c3h进化树,对其分子进化进行了探讨。

引用

页码：13 / 17

页数：5

共 4 条

[1] Unexpected behavior of coniferin in lignin biosynthesis of Ginkgo biloba L [J].

Tsuji, Y ;

Chen, F ;

Yasuda, S ;

Fukushima, K .

PLANTA, 2005, 222 (01) :58-69

[2]

Genetic and molecular basis of grass cell-wall degradability. I. Lignin–cell wall matrix interactions[J] . John H Grabber,John Ralph,Catherine Lapierre,Yves Barrière.Comptes rendus - Biologies . 2004 (5)

[3]

Lignin: Genetic Engineering and Impact on Pulping[J] . Marie Baucher,Claire Halpin,Michel Petit-Conil,Wout Boerjan.Critical Reviews in Biochemistry and Molecular Bi . 2003 (4)

[4]

LIGNIN BIOSYNTHESIS[J] . Wout Boerjan,John Ralph,Marie Baucher.Annual Review of Plant Biology . 2003 (1)

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