目的了解肇庆市城区居民的主要腹泻病原菌,为建立食源性疾病主动监测体系,提供必要的监测数据。方法采集监测点腹泻门诊腹泻患者粪便(或肛拭)标本,分离沙门氏菌、志贺氏菌、霍乱、肠出血性大肠杆菌EHECO157:H7和副溶血性弧菌。结果314份标本共分离各类病原菌51株(16.24%),其中,以副溶血性弧菌检出率为最高,占总检出率的49.02%,沙门氏菌、志贺氏菌的检出率分别为25.49%和15.69%,霍乱、肠出血性大肠杆菌EHECO157:H7未检出;女性患者病原菌检出率显著高于男性患者(P<0.01);50.98%的患者年龄集中在21~40岁(P<0.001);检出的25株副溶血性弧菌分属其6个血清型,其中O3和O4血清型最为多见,分别占64.00%和20.00%。结论肇庆市城区居民主要腹泻病原菌为副溶血性弧菌O3血清型,患者主要为中青年。