20世纪90年代以来,随着新疆棉花生产迅速的发展,棉花生产对自治区国民经济的发展起到了极其重要的作用,棉花收入也成为新疆农民收入的重要来源。新疆已初步形成了三个产棉区,即南疆棉区、北疆棉区和东疆棉区。南疆棉区是新疆棉花的主产区,其棉花产量约占新疆棉区产量的80%,也是我国最适宜的植棉地区,是长绒棉的生产基地。2006年南疆棉花播种面积731.13千公顷,总产达到138.9万吨,南疆棉花的发展对新疆棉花的发展,乃至全国棉花的发展起着决定性的作用,南疆棉花与我国三大主产棉区长江流域棉区,黄河流域棉区,西北内陆棉区比较是否有优势。