目的:从舌苔蛋白质组探讨舌苔原理及其微观规律。方法:对以固相pH梯度等电聚焦为第一向、垂直SDS-PAGE为第二向的双向电泳技术中的关键因素与环节进行研究和实验条件的优化。并对其4组舌苔组织的蛋白质组进行分离,银染显色,凝胶扫描入计算机,ImageMaster2DPlatinum软件分析比较电泳图谱。结果:建立并优化了蛋白质组学分析中的双向电泳技术,建立了蛋白质组研究中的图像分析体系,获得了分辨率和重复性均较好的双向电泳银染图谱;对4组舌苔组织的蛋白质组进行分离分析,发现凝胶中可检测的蛋白质斑点数分别为(1082±105)个、(1052±85)个、(1129±98)个、(1143±140)个;进一步的分析显示,病理薄苔组与正常舌苔组相比,有6个蛋白质点表达上调,8个为表达下调;厚苔组与正常舌苔组相比,有6个蛋白质点表达上调,7个为表达下调;剥苔组与正常组相比,有8个蛋白质点表达上调,7个为表达下调。结论:舌苔的蛋白质组学研究可以为中医临床辨证、中医疗效评价、中药药效学研究及中药新药筛选研究提供具有中医特色的微观指标和科学依据。