我国新分离ECHO30病毒VP1序列分析

被引：7

作者：

赵雅男

姜庆五

姜仁杰

沈进进

陈胤忠

汪华

机构：

[1] 复旦大学公共卫生学院流行病学教研室,复旦大学公共卫生学院流行病学教研室,江苏省盐城市疾病预防控制中心,江苏省盐城市疾病预防控制中心,江苏省盐城市疾病预防控制中心,江苏省疾病预防控制中心公共卫生安全教育部重点实验室,上海,公共卫生安全教育部重点实验室,上海,盐城,盐城,盐城,南京

来源：

病毒学报 | 2005年 / 02期

关键词：

ECHO30; 无菌性脑膜炎; 肠道病毒; 序列分析; 同源性;

D O I：

10.13242/j.cnki.bingduxuebao.001519

中图分类号：

R373 [人体病毒学（致病病毒）];

学科分类号：

100103 ; 100705 ;

摘要：

测定了引起2003年苏北地区无菌性脑膜炎暴发流行的病因病毒FDJS03分离株的VP1基因序列,并与国外同型流行毒株做比较,以了解本流行株的分子生物学特点及遗传变异规律。随机选取FDJS03分离毒株中的4株,用肠道病毒VP1序列的特异性引物008/011进行RT—PCR,扩增产物经凝胶纯化后测序。将序列输入GenBank,用BLAST程序进行核苷酸和氨基酸序列比对;选取32株不同地区不同年代的ECHO30分离毒株,在PHYLIP3.573c和TREE—PUZZLE5.0中构建进化树,比较它们完整VP1序列(876nt)的进化关系。核苷酸和氨基酸同源性比较结果证明:4株分离病毒均为ECHO30。进化树分析显示:本次FDJS03分离株与欧美20世纪70、80年代流行株亲缘关系最近,但自成一簇,与国外毒株仍然有地区差别。ECHO30的VP1基因进化有时间效应,但存在地区差异。本次流行的病原可能是单一基因型的ECHO30病毒。

引用

页码：101 / 105

页数：5

共 2 条

[1]

Molecular epidemiology of echovirus 30 in Europe: succession of dominant sublineages within a single major genotype[J] . C. Savolainen,T. Hovi,M. N. Mulders.Archives of Virology . 2001 (3)

[2] An echovirus 30 outbreak with a high meningitis attack rate among children and household members at four day-care centers [J].

Vieth, UC ;

Kunzelmann, M ;

Diedrich, S ;

Timm, H ;

Ammon, A ;

Lyytikäinen, O ;

Petersen, LR .

EUROPEAN JOURNAL OF EPIDEMIOLOGY, 1999, 15 (07) :655-658

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