胶质瘤诱导分化相关基因的生物信息学分析

被引：8

作者：

孙继勇

黄强

王爱东

孙立军

董军

兰青

机构：

[1] 苏州大学附属第二医院神经外科暨脑肿瘤研究室

来源：

中华实验外科杂志 | 2003年 / 04期

关键词：

胶质瘤; 分化; 基因表达;

D O I：

暂无

中图分类号：

R739.4 [神经系肿瘤];

学科分类号：

100115 [医学神经生物学];

摘要：

目的　探讨胶质瘤诱导分化的分子调控机制 ,寻找与分化过程密切相关的关键基因。方法　苯丁酸钠诱导SHG 4 4 9胶质瘤细胞株 ,诱导前和诱导 2h、6d后作cDNA微阵列建立基因表达谱 ,然后利用生物信息学工具对表达谱数据做系统的聚类分析和生物信息库检索。结果　对差异 2倍以上的 115个基因作聚类分析 ,得到 6大类不同表达模式的基因类别。进一步生物信息学分析表明 ,其中有 11条基因的功能信息与诱导分化关系密切 ,可能是这一过程的关键基因。结论　生物信息学是分析基因表达谱的有力工具 ,可以很好的从表达谱数据提取出与诱导分化相关的关键基因 ,可供进一步研究。

引用

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