苹果α-法尼烯合酶基因组结构和序列的多态性分析

被引：8

作者：

苑克俊

刘庆忠

李勃

张力思

机构：

[1] 山东省果树研究所

来源：

园艺学报 | 2007年 / 04期

基金：

教育部留学回国人员科研启动基金;

关键词：

苹果; α-法尼烯合酶; 基因组DNA; 多态性; 虎皮病;

D O I：

10.16420/j.issn.0513-353x.2007.04.035

中图分类号：

S661.1 [苹果];

学科分类号：

090201 ;

摘要：

通过设计引物进行PCR扩增、测序、拼接序列,以及与GenBank中的cDNA序列(登录号AY182241)进行比对,获得α-法尼烯合酶基因(AFS)的基因组序列和内含子/外显子结构。获得的AFS基因序列已在GenBank注册(登录号DQ901739),它有6个内含子和7个外显子,编码一个大小为576个氨基酸的蛋白质。间隔外显子的6个内含子相位分别是0、1、2、2、0、0,其大小分别是108、113、>1000、125、220和88bp,7个外显子的推导氨基酸序列大小分别是57、89、127、73、48、83和99。编码的蛋白质中有3个序列模式(motif),RR(X8)W模式的编码基因序列在基因5′端的外显子1上,RxR模式和DDxxD模式的编码基因序列在外显子4上。将获得的AFS基因序列与GenBank中的cDNA序列(登录号AY523409)进行比对,结果发现两序列间有6个单核苷酸多态性,其中4个引起氨基酸突变。有意义的是,1个氨基酸突变(291R→G)发生在RxR模式上,此氨基酸突变以及其它突变是否与苹果α-法尼烯合成能力和虎皮病发生能力有关,值得进一步探讨。

引用

页码：1003 / 1006

页数：4

共 5 条

[1] 苹果AFS基因的克隆与原核表达 [J].

李萌 ;

隋娜 ;

张元湖 ;

孟庆伟 .

园艺学报, 2006, (01) :122-124

[2] 改进的拟南芥CAPS标记方法 [J].

苑克俊 .

农业生物技术学报, 2005, (05) :35-41

[3] 改良CTAB法用于多年生植物组织基因组DNA的大量提取 [J].

陈昆松 ;

李方 ;

徐昌杰 ;

张上隆 ;

傅承新 .

遗传, 2004, (04) :529-531

[4] 水稻OsBP-73基因表达需要其内含子参与 [J].

陈俊 ;

王宗阳 .

植物生理与分子生物学学报, 2004, (01) :81-86

[5]

Cloning and functional expression of an （ E , E ）-α-farnesene synthase cDNA from peel tissue of apple fruit[J] . Steven W. Pechous,Bruce D. Whitaker.Planta . 2004 (1)

← 1 →