基于VP4基因扩增和序列测定快速检测鉴别人肠道病毒的研究

被引:7
作者
颜瑾
柯昌文
郑焕英
郭雪
刘冷
机构
[1] 广东省疾病预防控制中心
基金
广东省科技计划;
关键词
人肠道病毒; VP4基因; 序列测定分析;
D O I
暂无
中图分类号
R450 [];
学科分类号
100215 ;
摘要
目的建立基于小核糖核酸(RNA)病毒结构蛋白HVP4基因序列测定,对人肠道病毒(HEV)进行快速检测和分型的分子生物学方法。方法应用逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)对2004年321例急性弛缓性麻痹(AFP)病例粪便标本进行病毒核酸提取和扩增VP4基因,然后对扩增产物测序,通过序列的分析鉴定病毒型别。结果321份AFP病例粪便标本上清液,共检出阳性134份。获得VP4有效序列54条,其中37例RD、L20B细胞培养未检出的样本,检出HEV10例,脊髓灰质炎病毒(PV)5例,柯萨奇病毒(CV)9例,人鼻病毒(HRV)12例,埃可病毒(ECV)1例;9例细胞培养为其它HEV的样本,检出CV5例,EV2例,HRV2例;RD、L20B细胞培养结果6例与VP4测序结果相符。结论应用VP4序列测定对HEV进行快速诊断和分型是一种快速简单的分子生物学方法,可用于HEV感染引起的爆发疫情的病原学诊断。
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共 2 条
[1]  
Molecular diagnosis of humanenteroviruses by phylogeny-based classification by use of the VP4se-quence. Hiroaki I,Yasushi S,Mari Y,et al. The Journal of Infectious Diseases . 2002
[2]  
A sabin 3-derived poliovirusrecombinant contained a sequence homologous with indigenous hu-man enterovirus species C in the viral polymerase coding region. Arita M,Zhu S L,Yoshida H,et al. Journal of Virology . 2005