湖南省2004年流感病毒优势流行毒株甲3亚型基因特性分析

被引：7

作者：

龙智钢 ^{[1
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刘运芝 ^{[1
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张烨 ^{[2
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张红 ^{[1
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温乐英 ^{[2
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李梓 ^{[2
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黄一伟 ^{[1
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机构：

[1] 湖南省疾病预防控制中心

[2] 中国疾病预防控制中心病毒预防控制所流感研究室

来源：

中国卫生检验杂志 | 2006年 / 02期

关键词：

流感病毒; HA1基因; 氨基酸序列; 种系发生树;

D O I：

暂无

中图分类号：

R373 [人体病毒学（致病病毒）];

学科分类号：

100103 ; 100705 ;

摘要：

目的:了解2004年湖南省流感病毒优势流行毒株甲3亚型的基因特性变异特征。方法:取病原学监测中分离到的13株甲3亚型流感病毒毒株,经鉴定后用鸡胚传代,收获尿囊液提取病毒RNA,进行逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR),扩增产物用纯化试剂盒纯化后测序;测序结果使用F lu Sequence DatasetExp lorer工具进行比较,通过与NCB I数据库中2000～2005年中国的流感病毒H3N2株同源比对后,绘制种系发生树。结果:所测13株甲3(H3N2)亚型毒株的HA1区的320个氨基酸,与甲3亚型国际疫苗株A/W uhan/359/1995相比,抗原决定簇E区、A区、D区、B区及受体结合位点(RBS)后壁和左壁均有多个位点发生氨基酸替换。与2002年流行的A/Fu jian/411/2002甲3亚型代表株相比,抗原决定簇及受体结合位点亦有单个或多个位点氨基酸发生了替换。种系发生树显示,13株甲3亚型人流感病毒中有9株同源性较大,独立形成一簇,与A/Fu jian/52/2004较为接近。另外1株与我省2002年分离的毒株最为接近。最后3株则整合进2003～2004年其他省分离到的毒株所形成的簇中。结论:湖南省2004年流感优势流行毒株甲3亚型流感病毒的HA1基因特性发生了变异,可能是导致其流行的主要原因。在HA1基因进化上,时间比地理分布起着更重要的作用。

引用

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共 2 条

[1] 武汉市2003年流感监测及当前优势流行毒株的抗原性和基因特性分析 [J].