辽宁地区汉坦病毒分离株的基因分型

被引：6

作者：

董雪

张永振

李欣

赵常智

王冰

机构：

[1] 沈阳市疾病预防控制中心微生物检验科,中国疾病预防控制中心传染病控制所出血热室,沈阳市疾病预防控制中心微生物检验科,沈阳市疾病预防控制中心微生物检验科,沈阳市疾病预防控制中心微生物检验科,,,

来源：

中华实验和临床病毒学杂志 | 2005年 / 01期

关键词：

汉坦病毒; 逆转录聚合酶链反应; 基因型; 种系发生;

D O I：

暂无

中图分类号：

R373 [人体病毒学（致病病毒）];

学科分类号：

100103 ; 100705 ;

摘要：

目的　分离辽宁地区汉坦病毒并对分离株 (SY 13)进行基因分型 ,以查清辽宁地区汉坦病毒流行株的基因型和基因亚型。方法　采用组织细胞培养法分离汉坦病毒 ;用RT PCR法分别扩增SY 13的M片段G1、G2区和S片段 ;采用邻位相连法 ,通过DNAStar、Clustalx、Phylip等序列分析软件分别对 3个基因片段的序列与从GenBank下载的序列进行同源性分析 ,并构建种系发生树。结果　通过对 3个基因片段进行比较分析 ,SY 13与HTN型同源性较高 ,为 79.3%～ 97.0 % ;通过M片段G2区的比较分析 ,SY 13与BAO 10、BAO 14、JIANG 13、BAO 9、Q 33处于同一分支 ,同源性为 95.0 %～97.0 %。结论　辽宁地区汉坦病毒SY 13株与黑龙江地区分离株属同一亚型 ,为HTN型病毒中的H4亚型

引用

页码：39 / 42

页数：4

共 4 条

[1] 在我国发现普马拉(Puumala)型汉坦病毒 [J].

刘刚 ;

李川 ;

扈光伟 ;

李悦 ;

姚来顺 ;

陈玉庆 ;

黄飚 ;

任明 ;

陈允志 ;

吴世新 ;

于传友 ;

那宝终 ;

钟向东 ;

孙悦新 ;

李文新 ;

李德新 .

中华实验和临床病毒学杂志, 2002, (04) :111-111

[2] 我国汉坦病毒基因型和基因亚型的分布研究 [J].

王世文 ;

杭长寿 ;

王华 ;

解燕乡 ;

马本江 .

病毒学报, 2002, (03) :211-216

[3]

流行性出血热防治手册[M]. 人民卫生出版社 , 卫生部疾病控制司《流行性出血热防治手册》编写组编, 1998

[4]

Recombination in hantavirus evolution: Analysis of genetic lineages from Slovakia. Sibold C, Meisel H, Kruger D H, et al. Journal of Virology . 1999

← 1 →