坛紫菜微卫星DNA序列的筛选

被引：6

作者：

胡则辉

周志刚

严兴洪

机构：

[1] 上海水产大学农业部水产种质资源与养殖生态重点开放实验室,生命科学与技术学院

来源：

海洋科学 | 2006年 / 01期

关键词：

坛紫菜(Porphyra haitanensis); 微卫星; 筛选; 序列;

D O I：

暂无

中图分类号：

S968.4 [藻类养殖];

学科分类号：

090801 ;

摘要：

自坛紫菜(Porphyrahaitanensis)丝状体中提取的DNA,经Sau3AI限制性内切酶消化后,将300～900bp之间的DNA片段回收,并连接到经BamHI酶切并去磷酸化的pUC18载体上,最后转化至大肠杆菌JM109感受态细胞中,构建坛紫菜小片段DNA质粒文库。选用pUC18质粒的通用引物进行PCR反应,对文库进一步筛选并检测插入片段的大小,在384个阳性克隆中,有278个含有大小合适的插入片段。经测序及序列分析,在103个克隆中获得172个微卫星序列,其中完美型107个,占62.2%,非完美型53个,占30.8%。(GC)n与(CG)n在坛紫菜DNA中非常丰富,分别占25%及17%,但重复频率相对较低。

引用

页码：17 / 22

页数：6