江淮水牛线粒体D-loop区和Cytb基因遗传多态性及系统发育分析

被引:8
作者
卢永芳 [1 ]
蔡治华 [2 ]
李强 [1 ]
张毅 [1 ]
张勤 [1 ]
张沅 [1 ]
机构
[1] 中国农业大学动物科技学院
[2] 安徽科技学院动物科学学院
关键词
水牛; mtDNA; D-loop; 细胞色素b; 遗传多样性; 单倍型;
D O I
暂无
中图分类号
S823.83 [];
学科分类号
0905 ;
摘要
为研究安徽江淮水牛群体的分子种质特性,本试验测定了江淮水牛2个亚群共82个个体的线粒体D-loop区和细胞色素b基因完整序列,分析了序列遗传多态性及系统进化关系,并结合GenBank中已发表的141条中国水牛D-loop序列,进行了联合分析。结果在D-loop区内共发现核苷酸多态位点91个,组成104个单倍型,其中32个是在江淮水牛中新发现的单倍型。总体mtDNA D-loop区核苷酸多样性为(0.015 43±0.001 42),单倍型多样性为(0.948±0.009)。其中,江淮水牛的mtDNA D-loop区核苷酸多样性为(0.014 89±0.002 32),单倍型多样性为(0.955±0.013),表明其群体遗传多样性丰富,群体变异性水平与中国其他水牛群体接近。根据线粒体D-loop区单倍型构建系统树和进化网络,显示江淮水牛存在沼泽型水牛线粒体支系A和B,表明其具有2个线粒体母系来源,其中B支又分为b1和b2两个亚支;针对细胞色素b基因的进化分析也支持这一结论。这些研究结果为今后开展江淮水牛遗传资源的保护和利用提供了客观依据。
引用
收藏
页码:701 / 707
页数:7
相关论文
共 3 条
[1]   槟榔江水牛种质资源调查与评价 [J].
屈在久 ;
李大林 ;
苗永旺 ;
沈雪鹰 ;
尹玉安 ;
艾有林 .
云南农业大学学报, 2008, (02) :265-269
[2]   Independent maternal origin of Chinese swamp buffalo (Bubalus bubalis) [J].
Lei, C. Z. ;
Zhang, W. ;
Chen, H. ;
Lu, F. ;
Liu, R. Y. ;
Yang, X. Y. ;
Zhang, H. C. ;
Liu, Z. G. ;
Yao, L. B. ;
Lu, Z. F. ;
Zhao, Z. L. .
ANIMAL GENETICS, 2007, 38 (02) :97-102
[3]  
Water Buffalo ( Bubalus bubalis ): Complete Nucleotide Mitochondrial Genome Sequence[J] . Pietro Parma,Marta Erra-Pujada,Maria Feligini,GianFranco Greppi,Giuseppe Enne. Mitochondrial DNA . 2004 (5-6)