常见皮肤癣菌18S～28S rDNA ITS序列同源性分析

被引：25

作者：

王强 ^{[1
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冀朝辉 ^{[2
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李厚敏 ^{[1
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张丽娟 ^{[1
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刘伟 ^{[1
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万哲 ^{[1
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王小红 ^{[1
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王端礼 ^{[1
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李若瑜 ^{[1
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机构：

[1] 北京大学第一医院皮肤科

[2] 北京大学医学部基础医学院生物化学与分子生物学系

来源：

中华微生物学和免疫学杂志 | 2006年 / 04期

关键词：

皮肤癣菌; 内转录间隔区(ITS); 鉴定; 系统发生树;

D O I：

暂无

中图分类号：

R379 [病原真菌（霉菌）与放线菌];

学科分类号：

100103 [病原生物学];

摘要：

目的分析常见皮肤癣菌内转录间隔区(ITS,包括5．8S rDNA)序列,探讨快速、准确鉴定菌种的方法;建立种系发生进化树,了解其亲缘关系。方法用形态学方法对16株皮肤癣菌做初步鉴定,PCR扩增各菌ITS区,扩增产物纯化、DNA测序,做序列比对、分析,建立系统发生树。结果检测了16株菌,包括未见文献报道的猪小孢子菌的ITS全序列,其中11株菌与形态学结果一致,1株菌鉴定为金孢子菌,4株菌通过这两种方法均不能确定。在基于ITS序列构建的N-J系统树中,将皮肤癣菌分成3组,这与依形态学所分的3属不同。结论ITS区序列分析法具有高度的准确性、敏感性,检测范围广泛、快速,可应用于菌种鉴定。但也有局限性,应与形态学鉴定相互补充。ITS区序列为今后更加合理地分类和命名皮肤癣菌提供了参考依据。

引用

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