复发鼻咽癌差异基因分析及染色体定位初步研究

被引：2

作者：

黄振校 ^{[1
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李文峰 ^{[2
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林森 ^{[1
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黄亚 ^{[3
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杜季梅 ^{[4
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谭映霞 ^{[4
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方潇碧 ^{[1
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张春鸿 ^{[1
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方渭清 ^{[1
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廖志苏 ^{[1
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机构：

[1] 温州医学院附属第一医院耳鼻咽喉科

[2] 温州医学院附属第一医院放疗科

[3] 温州医学院附属第一医院八院区耳鼻喉科

[4] 温州医学院检验医学院

来源：

中华耳鼻咽喉头颈外科杂志 | 2010年 / 01期

关键词：

鼻咽肿瘤; 肿瘤复发,局部; 寡核苷酸序列分析; 基因表达; 染色体定位;

D O I：

暂无

中图分类号：

R739.63 [咽肿瘤];

学科分类号：

100213 [耳鼻咽喉科学];

摘要：

目的通过基因芯片和生物信息学来筛选复发鼻咽癌(recurrent nasopharyngeal carcinoma,rNPC)差异基因及染色体定位和功能分析。方法选择初发鼻咽癌(primary nasopharyngeal carcinoma,pNPC)和rNPC,应用Affymetrix Gene1.0 ST芯片筛选差异基因;应用生物信息学对差异基因进行染色体定位和功能分析。结果差异基因共44个,其中下调基因36个,上调基因8个。基因功能分类显示,下调基因大部分属于酶活性基因(10个,27.8%),其次为钙黏合基因(7个,19.4%)、蛋白结合基因(5个,13.9%),这3类基因占了下调基因总数的61.1%,另外,受体活性基因(4个,11.1%),转录因子基因和三磷酸腺苷黏合基因各2个(各占5.6%),细胞外基质黏合基因和生长因子黏合基因各1个(各占2.8%),4个基因的功能未知(11.1%);上调基因中,3个基因的功能未知(37.5%),酶活性基因(2个,25.0%),受体活性、钙黏合、电压门压通道调控基因各1个,各占12.5%。这些差异基因分布在大多数染色体上,主要分布在1和17号染色体上。1号染色体上包含10个基因(22.7%),17号染色体包含5个基因(11.3%)。结论差异基因分布在大多数染色体上,但主要分布在1和17号染色体上,酶活性、钙黏合及蛋白结合基因这三类差异基因可能在rNPC中扮演着重要的角色,需要进一步深入研究。

引用